Специализированную медицинскую помощь оказывают все стационары республики независимо от уровня. Коечный фонд стационаров включает более 60% специализированных коек, которые согласно утвержденным Министерством здравоохранения и социального развития Российской Федерации порядкам оказывают медицинскую помощь больным профильных заболеваний. Выбранные приоритеты по принципу значимости формирования причин смертности, больничной летальности, заболеваемости, в том числе социально значимыми заболеваниями, инвалидизации населения представлены следующими направлениями: