Программа наиболее тесно взаимосвязана с региональной целевой программой "Леса Ленинградской области", направленной на реализацию мероприятий по лесовосстановлению, и региональной целевой программой "Водоохранные и водохозяйственные работы в Ленинградской области" (строительство канализационно-очистных сооружений, сохранение качества поверхностных и грунтовых вод, обеспечение населения питьевой водой). Эти программы также курирует комитет по природным ресурсам и охране окружающей среды Ленинградской области.
Кроме того, Программа дополняет мероприятия, осуществляемые Правительством Ленинградской области в рамках реализации региональных целевых программ, курируемых различными структурными подразделениями Администрации Ленинградской области, а именно:
"Культура Ленинградской области";
"Лето";
"Развитие образования Ленинградской области";
"Развитие сферы туризма и рекреации Ленинградской области";
"Развитие и использование минерально-сырьевой базы Ленинградской области".