Для оценки природоохранной эффективности системы ООПТ автономного округа определяются ее полнота и достаточность площадей, необходимые для выполнения основных задач, по следующим показателям:
ландшафтная репрезентативность (представленность эталонных участков типичных ландшафтов с полными комплексами характерных для них экосистем);
экосистемно-биоценотическая репрезентативность (представленность разнообразия сообществ и экосистем, с особым вниманием к специфичным для региона реликтовым, редким, уникальным комплексам);
флористико-фаунистическая репрезентативность (представленность объектов животного и растительного мира, зарегистрированных в регионе, в том числе эндемичных для региона);
обеспечение сохранения жизнеспособных популяций редких и находящихся под угрозой исчезновения объектов животного и растительного мира, занесенных в Красную книгу Российской Федерации и Красную книгу автономного округа;
обеспечение воспроизводства объектов животного и растительного мира, являющихся ценными биологическими ресурсами (имеющими ценное промысловое, техническое, медицинское, научное значение), охрана ключевых местообитаний (мест размножения, нагула, выращивания молодняка, миграционных путей, места массового произрастания и т.п.) для сохранения популяций на уровне, позволяющем их неистощительное использование;
обеспечение сохранения редких и уникальных природных объектов, имеющих высокое (природоохранное, научно-познавательное, эстетическое, этническое, палеонтологическое) значение;
обеспечение экологической стабильности, особенно в районах интенсивного промышленного развития, а также поддержание естественных природных процессов;
обеспечение выполнения Россией международных обязательств в части охраны биологического и ландшафтного разнообразия за счет сохранения территорий, имеющих международное значение, в первую очередь - водно-болотных угодий международного значения (рамсарских угодий);
обеспечение сохранения туристско-рекреационного потенциала в регионе;
связанность ООПТ региона в единую экологическую сеть системой экологических коридоров;
связанность ООПТ региона в единую экологическую сеть с ООПТ соседних регионов системой экологических коридоров;
безопасность системы ООПТ и отдельных ООПТ (наличие различных негативных воздействий и потенциальных угроз для отдельных ООПТ и всей системы ООПТ в целом).
Результаты оценки природоохранной эффективности системы ООПТ автономного округа: