А.2.1 Основной метод на основе ПВП
А.2.1.1 Общие положения
Этот простой, быстрый и дешевый метод [19] пригоден для большой группы продуктов, особенно содержащих большие количества полифенольных соединений.
А.2.1.2 Статус валидации
Этот метод был проверен путем внутрилабораторных исследований и применяется для систематического выделения ДНК во многих лабораториях. Данный метод еще не оценивался путем официальных межлабораторных исследований.
А.2.1.3 Принцип
Метод включает стадию лизиса (термический лизис в присутствии додецилсульфата натрия и высокой концентрации ЭДТА) и последующее удаление из водной фазы, содержащей ДНК, загрязняющих примесей, например полифенольных молекул, полисахаридов, метаболитов и растворимых белков, с помощью ПВП в комбинации с ацетатом аммония. Последним этапом является осаждение ДНК этанолом, что концентрирует ДНК и очищает ее от солей (см. [19]-[23]).
А.2.1.4 Меры безопасности
Работы с органическими реактивами следует выполнять в вытяжном шкафу.
А.2.1.5 Реактивы
А.2.1.5.1 Этиловый спирт, , 96%-ный.
Следует хранить и использовать при температуре минус 20°С.
А.2.1.5.2 Изопропанол, .
А.2.1.5.3 Поливинилпирролидон (ПВП), молекулярная масса 360 кДа; характеристическая вязкость (значение К) = 80-100.
_______________
SIGMA Р-5288 - пример подходящего реактива, имеющегося в продаже. Эта информация приводится для удобства пользователей настоящего стандарта и не означает обязательность его применения. Могут использоваться эквивалентные реактивы, если их применение приводит к тем же результатам.
А.2.1.5.4 Ледяная уксусная кислота, .
А.2.1.5.5 Соляная кислота, HCI, 37%-ная.
А.2.1.5.6 Хлорид натрия, NaCI.
А.2.1.5.7 Трис(оксиметил) аминометан (Трис), .
А.2.1.5.8 Этилендиаминтетрауксусной кислоты двунатриевая соль (), .
А.2.1.5.9 Додецилсульфат натрия (SDS), .
А.2.1.5.10 Ацетат аммония, .
А.2.1.5.11 Раствор этилового спирта, , 70%-ный.
Следует хранить и использовать при температуре минус 20°С.
А.2.1.5.12 Буфер для экстрагирования, рН = 8,0 ед., (Трис) = 0,2 моль/дм, (NaCI)=0,250 моль/дм, () = 0,025 моль/дм, (SDS) = 50 г/дм.
Доводят значение рН до 8,0 ед. рН, используя HCI или NaOH.
А.2.1.5.13 Раствор ацетата аммония, () = 7,5 моль/дм.
Растворяют в стерильной воде. При необходимости пропускают через фильтр с размером пор 0,22 мкм.