Причины отклонения от стандартного хода анализа и способы их устранения
Таблица А.1
Отклонение | Возможные причины | Способы устранения |
1 Полосы по краям геля расположены выше, чем в центре | Центральная часть геля нагревается сильнее краев | Центральный резервуар заполнить охлаждающим раствором |
Избыточное напряжение | Охлаждающий раствор прокачивать при температуре (10-15)°С; уменьшить напряжение | |
2 Диффузия лидирующего красителя | Распад раствора белков пробы и/или растворов буферов | Приготовить растворы из свежих реактивов |
Диффузия | Если полосы белка имеют такой же диффузный характер, как и полоса лидирующего красителя, увеличить силу тока на (25-50)% | |
3 Вертикальная исчерченность трека | Избыточная концентрация белков в пробе | Уменьшить концентрацию белков в пробе; уменьшить напряжение на 25% |
4 Горизонтальная исчерченность трека | Неполное растворение белков | Полностью растворить пробу; центрифугировать |
5 Широкие или размытые полосы или пятна белков | Диффузия в связи с медленной миграцией | Увеличить силу тока на 20% |
Химические модификации ионными загрязнениями | Деионизовать раствор карбомида | |
Неполное обезжиривание пробы | Полностью удалить жир | |
6 Размывание полос в латеральном направлении | Диффузия растворов белков за пределы лунок до включения напряжения | Уменьшить время между внесением пробы и подачей напряжения |
7 Искривленные полосы | Недостаточная полимеризация геля вокруг лунок | Дегазировать раствор мономеров геля; увеличить концентрации аммония надсернокислого и N, N, N', N'-тетраметилэтилендиамина на 25% |
Наличие солей в пробе | Удалить соли диализом | |
Неровная поверхность геля | Проверить стадию взятия проб для приготовления геля, при необходимости заменить реактивы | |
8 Электрофорез занимает более 5 ч | Высокая концентрация электродного буфера | Проверить стадию приготовления электродного буфера (при необходимости разбавить буфер), проверить качество дистиллированной воды, заменить реактивы |
Низкое напряжение | Увеличить напряжение на (25-50)% | |
9 Электрофорез идет слишком быстро с плохим разрешением | Буфер слишком разбавлен | Проверить стадию приготовления электродного буфера, проверить качество дистиллированной воды, заменить реактивы |
Слишком высокое напряжение | Уменьшить напряжение на (25-50)% | |
10 Наблюдается несовпадение полос в контрольных пробах | Часть белка могла окислиться во время электрофореза или не была полностью восстановлена на стадии подготовки пробы | Приготовить свежие контрольные пробы; заменить реактивы |