Выполнение Программы осуществляется через систему областных и ведомственных целевых программ, а также федеральных проектов и программ, реализуемых на территории области. Программа, являясь собирательным документом, выполняет функцию синхронизации государственной федеральной, областной и муниципальной политики, инициатив частного сектора на территории Пензенской области.
Все действующие и разрабатываемые целевые программы и проекты встраиваются в единую конструкцию, задаваемую настоящей Программой.
Процессуальный механизм реализации Программы представляет собой совокупность механизмов реализации областных и ведомственных целевых программ, а также федеральных проектов и программ.
Правительством Пензенской области принято постановление от 06.05.2008 N 288-пП "Об утверждении порядка разработки, утверждения и реализации ведомственных целевых программ Пензенской области", которое утверждает порядок разработки, утверждения и реализации ведомственных целевых программ субъектов бюджетного планирования Пензенской области.