В пространственном отношении территориальную структуру хозяйства республики образуют районы, объединенные в экономические зоны - Центральную, Западную, Восточную, Южную и Арктическую.
В Центральной Якутии будет образована Якутская агломерация, формирующая транспортно-логистический центр, основанный на использовании транзитного потенциала региона в магистралях "Север - Юг" и "Запад - Восток" со строительством мостового перехода через реку Лену, объединяющего железнодорожную магистраль "Беркакит - Томмот - Якутск" с федеральными и республиканскими автомобильными дорогами, международным аэропортом и речным портом.
Строительство мостового перехода через реку Лену в районе города Якутска и завершение строительства федеральной автомобильной дороги "Вилюй" от города Якутска до населенного пункта Верхнемарково (Иркутская область) позволит сформировать Северный широтный транспортный пояс Российской Федерации - сквозную магистраль, связывающую Иркутскую область через территорию Якутии с Магаданской областью и Хабаровским краем, с выходом к Охотскому морю.
Создание нового транспортного коридора позволит вовлечь в хозяйственный оборот страны колоссальные пространства с ресурсами общемирового значения. Разведанные запасы уже реализуемых в зоне тяготения к данной магистрали проектов оцениваются в 216 трлн. рублей, что в 2,3 раза превышает внутренний валовый продукт Российской Федерации.
На базе Жатайского судоремонтно-судостроительного завода будет реализован проект строительства современной высокотехнологичной судостроительной верфи, направленный на строительство судов для бесперебойного обеспечения грузоперевозок внутренним водным транспортом в Ленском бассейне.
Центром агломерации станет город Якутск - научно-образовательный и культурный центр региона, на территории которого развивается многопрофильная производственная ТОР "Якутия", ориентированная на производство строительных материалов, современные агротехнологии, выпуск ювелирной продукции на экспорт.
(в ред. Закона Республики Саха (Якутия) от 18.06.2020 2247-З N 403-VI)
Одним из приоритетных направлений экономики Центральной Якутии и республики в целом должно стать развитие креативных индустрий, в том числе сферы информационных технологий, киноиндустрии и туризма.
На тяготеющей к Якутской агломерации территории будут сформированы две агропромышленные зоны - Хангаласская и Заречье, получит комплексное развитие монопрофильное муниципальное образование "Поселок Мохсоголлох".
Развитие Южной экономической зоны связано с реализацией инвестиционных проектов по созданию новых мощностей по добыче и переработке полезных ископаемых и их транспортировке к потребителям в Российской Федерации, а также на экспорт в страны Азиатско-Тихоокеанского региона.
Продолжается освоение Эльгинского месторождения - одного из крупнейших в мире месторождений высококачественного коксующегося угля, запасы которого составляют около 2 млрд. тонн в соответствии со стандартами JORC.
По мере темпов освоения месторождения планируется создание постоянного населенного пункта с использованием инструментов адресной инфраструктурной поддержки инвесторов.
Проект предполагает доведение временного вахтового поселка до статуса постоянного для проживания.
Развитие ТОСЭР "Южная Якутия", кроме добычи и обогащения угля на Инаглинском и Денисовском месторождениях, предполагает развитие вспомогательных производств и переработки продукции.