Основными проблемами в системе высшего профессионального образования являются:
несоответствие объемов, структуры и качества подготовки кадров требованиям рынка труда, общества, государства;
недостаточный уровень экспорта и импорта технологий, знаний, образовательных услуг;
отставание качества образования от требований международных стандартов;
отсутствие института независимых рейтингов качества вузов;
снижение требований к качеству образования в преобладающей части коммерческого сегмента высшей школы;
недостаточная прозрачность деятельности вузов для студентов и работодателей, неразвитость институтов общественного управления.