Система управления реализацией Республиканской программы и разграничение функций управления между федеральными органами государственной власти и органами республиканской власти Республики Ингушетия определяются Федеральным законом от 29 декабря 2006 года N 264-ФЗ "О развитии сельского хозяйства" и Федеральным законом от 6 октября 1999 г. N 184-ФЗ "Об общих принципах организации законодательных (представительных) и исполнительных органов государственной власти субъектов Российской Федерации".
Практика реализации Республиканской программы "Развития сельского хозяйства и регулирования рынков сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия на 2008-2012 годы" утверженной Законом Республики Ингушетия от 5 декабря 2007 года N 46-рз указывает на высокую эффективность использования программно-целевых методов повышения эффективности использования финансовых средств, выделяемых на развитие отрасли, повышение конкурентоспособности продукции агропромышленного комплекса, социальное развитие сельских территорий.
Вместе с тем сохраняется проблема обеспечения выполнения финансирования основных мероприятий Республиканской программы, доведения федеральных и республиканских бюджетных средств до непосредственных их получателей, достижения прогнозных показателей, соответствия количества и качества предоставления государственных услуг финансовым затратам на их оказание в электронном виде.
Все это требует дальнейшего совершенствования организации управления Республиканской программой на всех уровнях ее реализации, создания условий для более эффективного использования организационно-экономических рычагов для повышения финансовой устойчивости сельскохозяйственного производства, в том числе за счёт создания государственной автоматизированной системы управления агропромышленного комплекса.
Реализации подпрограммы предполагает дальнейшее совершенствование взаимоотношений федеральных и региональных органов управления агропромышленным комплексом, ответственных за выполнение Республиканской программы, что позволит обеспечить повышение эффективности использования бюджетных средств, выделяемых на ее финансовое обеспечение и достижение предусмотренных подпрограммой показателей.