В целях повышения эффективности управления в сфере здравоохранения Красноярского края планируется выполнить работы по созданию и внедрению системы электронного документооборота, которая должна обеспечить оперативный документационный обмен между министерством здравоохранения Красноярского края, Территориальным фондом обязательного медицинского страхования, подведомственными медицинскими учреждениями, а также муниципальными органами управления здравоохранением.
Для осуществления статистического наблюдения в крае в 2002 году внедрена информационная система "Статистика" (разработка КГБУЗ "Красноярский краевой медицинский информационно-аналитический центр"). В 2006 году система была дополнена web-модулем для решения задачи мониторинга реализации приоритетного национального проекта "Здоровье". В 2011 году планируется расширение функционала web-модуля для задачи мониторинга Программы модернизации здравоохранения Красноярского края. Предусматривается также интеграция региональной системы мониторинга с федеральным информационным ресурсом.