Мониторинг хода выполнения Программы осуществляет координатор Программы - министерство здравоохранения края.
Исполнители Программы ежеквартально не позднее 20 числа месяца, следующего за отчетным, представляют государственному координатору Программы информацию о ходе ее реализации в соответствии с Порядком принятия решений о разработке долгосрочных краевых целевых программ, их формирования и реализации, утвержденным постановлением Правительства края от 06 октября 2008 г. N 236-пр "Об утверждении Порядка принятия решений о разработке долгосрочных краевых целевых программ, их формирования и реализации и Порядка проведения оценки эффективности реализации долгосрочных краевых целевых программ". Кроме того, исполнители Программы ежегодно в феврале года, следующего за отчетным, представляют заказчику Программы доклад о ходе работ по реализации Программы в соответствии с вышеуказанным постановлением.
Заказчик Программы ежеквартально в срок до 30 числа месяца, следующего за отчетным периодом, готовит сводный отчет о достигнутых показателях и целевых индикаторах, ходе выполнения и финансирования мероприятий Программы; ежегодно в срок до 15 марта года, следующего за отчетным, готовит доклад о ходе реализации Программы за отчетный год.
Заказчик и исполнители Программы организуют проверки хода реализации Программы. При этом обращается внимание на соблюдение сроков реализации мероприятий Программы, целевое и эффективное использование средств, выделяемых на их реализацию, привлечение внебюджетных средств, достижение конечных результатов Программы.
По результатам проверок для внесения в Правительство края подготавливаются предложения о целесообразности проведения отдельных мероприятий и финансирования Программы или об их прекращении, уточнении объемов финансирования, о применении санкций к участникам реализации Программы.