1. Управление реализацией программы осуществляет министерство сельского хозяйства и продовольственной политики Красноярского края, министерство строительства и архитектуры Красноярского края, служба финансово-экономического контроля Красноярского края.
2. Министерство строительства и архитектуры Красноярского края, служба по ветеринарному надзору Красноярского края ежемесячно до 10 числа месяца, следующего за отчетным, и по итогам года до 20 января очередного финансового года направляют в министерство сельского хозяйства и продовольственной политики Красноярского края информацию и отчет об использовании мероприятий, предусмотренных программой
3. Министерство сельского хозяйства и продовольственной политики Красноярского края ежемесячно до 15 числа месяца, следующего за отчетным, и по итогам года до 25 января очередного финансового года направляет в министерство экономики и регионального развития Красноярского края информацию и отчет об исполнении программы по форме согласно приложениям № 3 и № 4 к Порядку принятия решений о разработке долгосрочных целевых программ и их формирования и реализации, утвержденному постановлением Правительства Красноярского края от 03.12.2008 № 211-п.
4. Министерство сельского хозяйства и продовольственной политики Красноярского края до 1 февраля года, следующего за отчетным, направляет в министерство экономики и регионального развития Красноярского края ежегодный доклад об исполнении программы с оценкой достижения плановых показателей, динамики финансирования и выполнения за весь период реализации программы и по планируемым мероприятиям на очередной финансовый год.
5. Министерство сельского хозяйства и продовольственной политики Красноярского края ежегодно уточняет целевые показатели и затраты по программным мероприятиям, механизм реализации программы, состав исполнителей с учетом выделяемых на ее реализацию финансовых средств.
6. Контроль за целевым использованием бюджетных средств осуществляет служба финансово-экономического контроля Красноярского края.