Контроль за ходом исполнения подпрограммы осуществляется в соответствии с постановлением администрации области от 16 мая 2008 года N 472 "Об утверждении Порядка принятия решений о разработке долгосрочных целевых программ, их формирования и реализации". Текущее управление подпрограммой осуществляется администрацией Брянской области (комитетом по науке администрации области).