Управление реализацией программы осуществляет исполнительный орган государственной власти области, осуществляющий функции в сфере сельского хозяйства.
Исполнительный орган государственной власти области, осуществляющий функции в сфере сельского хозяйства:
1) обеспечивает согласованность действий по реализации основных мероприятий программы, целевому и эффективному использованию областных средств;
2) осуществляет взаимодействие с исполнителями программы по вопросам государственной поддержки развития агропромышленного производства.
Элементами механизма реализации программы являются:
1) программно-целевое и индикативное планирование развития агропромышленного производства области;
2) привлечение средств федерального бюджета в рамках реализации федеральных целевых программ;
3) прямое финансирование, льготное кредитование, предоставление гарантий и субсидирование процентной ставки по банковским кредитам из областного бюджета;
4) прямой диалог и согласование действий с производителями сельскохозяйственной продукции, компаниями - поставщиками сельскохозяйственной техники, расходных материалов, удобрений, пестицидов, горюче-смазочных материалов, инвесторами.
Контроль за реализацией мероприятий программы, целевым и эффективным использованием средств областного бюджета осуществляет исполнительный орган государственной власти области, осуществляющий функции в сфере сельского хозяйства.
По результатам полугодия и отчетного года областному Совету народных депутатов и контрольно-счетной палате области исполнительным органом государственной власти области, осуществляющим функции в сфере сельского хозяйства представляется информация о ходе выполнения программы в соответствии с Законом Амурской области от 01.09.2005 № 36-ОЗ «Об областных целевых программах».