Управление Программой осуществляют:
Департамент природных ресурсов и охраны окружающей среды Томской области в части организации мероприятий по поддержанию природной способности водных ресурсов к самоочищению и предотвращению деградации;
органы местного самоуправления муниципальных образований Томской области (по согласованию) в части проведения работ по модернизации находящихся в муниципальной собственности очистных сооружений по очистке сточных вод.
Текущий контроль и мониторинг реализации Программы осуществляет Департамент природных ресурсов и охраны окружающей среды Томской области.
Исполнители Программы представляют отчеты:
по формам, утвержденным Министерством природных ресурсов и экологии Российской Федерации и Федеральным агентством водных ресурсов, в установленные ими сроки заказчику Программы;
о реализации Программы и об использовании финансовых средств по установленной заказчиком Программы форме ежеквартально, до 5-го числа месяца, следующего за отчетным периодом, заказчику Программы.
Оценка социально-экономической эффективности реализации Программы проводится ежегодно путем сравнения текущих значений основных целевых показателей с установленными Программой значениями.
Департамент природных ресурсов и охраны окружающей среды Томской области представляет ежеквартально в Департамент экономики Администрации Томской области отчет о реализации Программы по установленным формам и в установленные сроки.
Целевые показатели и объемы финансирования мероприятий Программы, а также механизм реализации Программы уточняются ежегодно в установленном законодательством порядке с учетом выделяемых на реализацию Программы финансовых средств. На основе оценки показателей и целевых индикаторов определяются промежуточные результаты реализации Программы. Оценка реализации Программы осуществляется ежегодно в соответствии с критериями оценки эффективности, установленными Администрации Томской области от 22.06.2012 № 237а «О государственных программах Томской области».