Взаимодействие между государственными заказчиками подпрограмм осуществляет государственный заказчик-координатор - министерство здравоохранения и социальной поддержки области.
Текущее управление реализацией подпрограмм осуществляется органами исполнительной власти области - государственными заказчиками соответствующих подпрограмм.
Ежегодно при формировании бюджета на очередной финансовый год министерство здравоохранения и социальной поддержки области с участием государственных заказчиков подпрограмм, министерства экономического развития и торговли области и министерства финансов области уточняет основные показатели и затраты по программным мероприятиям, оценочные показатели, состав исполнителей и вносит соответствующие предложения в Правительство области.
Контроль за исполнением Программы осуществляется министерством здравоохранения и социальной поддержки области совместно с министерством экономического развития и торговли области в соответствии с постановлением Правительства области от 3 июня 2003 года N 61-П "О порядке разработки и реализации областных целевых программ".