Департаментом за весь период действия госзаказа проводится его ежегодное формирование и размещение, контроль за успеваемостью студентов и слушателей, прохождением их практики, тематикой дипломных работ, исполнением договорных обязательств и фактическим трудоустройством и дальнейшим использованием специалиста.
Финансирование госзаказа проводится в пределах сметы содержания департамента за счет средств, предусмотренных на переподготовку кадров.
Стоимость средств, затраченных на обучение специалистов агропромышленного комплекса области в рамках госзаказа, в соответствии со ст. 17 Закона РФ "О высшем и послевузовском профессиональном образовании" от 22.08.96 N 125-ФЗ (НГР:RU0000R199604175) и письмом Государственной налоговой службы Российской Федерации от 06.08.97 N 08-1-063822, 823 не подлежит налогообложению.