В соответствии с Положением о Министерстве транспорта Российской Федерации, утвержденным постановлением Правительства Российской Федерации от 30 июля 2004 года N 395, полномочия по выработке государственной политики и нормативно-правовому регулированию в сфере транспорта, в том числе внутреннего водного транспорта, возложены на Министерство транспорта Российской Федерации.
В соответствии с Положением о Федеральной службе по надзору в сфере транспорта, утвержденным постановлением Правительства Российской Федерации от 30 июля 2004 года N 398, разрешительные, контрольные и надзорные функции возложены на Федеральную службу по надзору в сфере транспорта, в составе которой образованы территориальные органы государственного надзора на внутреннем водном транспорте.
В соответствии с Положением о Федеральном агентстве морского и речного транспорта, утвержденным постановлением Правительства Российской Федерации от 23 июля 2004 года N 371, федеральным органом исполнительной власти, осуществляющим функции по оказанию государственных услуг и управлению государственным имуществом (в том числе переданному подведомственным федеральным государственным учреждениям и федеральным государственным унитарным предприятиям) в сфере внутреннего водного транспорта, является Федеральное агентство морского и речного транспорта.
На бассейновом уровне управление, содержание внутренних водных путей и СГТС в настоящее время осуществляют 15 федеральных государственных учреждений - государственных бассейновых управлений водных путей и судоходства и федеральное государственное унитарное предприятие "Канал имени Москвы", в составе которых функционируют 92 филиала (районы водных путей, районы гидротехнических сооружений, подразделения технологической связи, ремонта судов и других технических средств путевого хозяйства), а также федеральное государственное учреждение "Речная администрация Московского бассейна". Общая штатная численность работающих в организациях внутренних водных путей составляет около 32 тыс.человек.
В соответствии с постановлением Правительства Российской Федерации от 5 января 1995 года N 12 основными функциями государственных бассейновых управлений водных путей и судоходства Министерства транспорта Российской Федерации являются: осуществление во взаимодействии с органами исполнительной власти субъектов Российской Федерации эксплуатации и развития водных путей и гидротехнических сооружений, государственного регулирования деятельности хозяйствующих субъектов речного транспорта всех форм собственности по вопросам, отнесенным к компетенции государственных органов, контроля за обеспечением безопасности судоходства, экологической и пожарной безопасности, надзора за технической эксплуатацией объектов речного транспорта, находящимися в федеральной собственности.
В соответствии с Уставами, государственные бассейновые управления водных путей и судоходства оказывают государственные услуги, осуществляют хозяйственную, предпринимательскую и иную деятельность, приносящую доход.
В настоящее время созданы необходимые правовые условия для обеспечения участия субъектов Российской Федерации в развитии речных портов, деятельность которых связана преимущественно с социально-экономическими потребностями регионов, в том числе по организации транспортного обслуживания населения.
В соответствии с изменениями, внесенными Федеральным законом от 25.11.2008 N 221-ФЗ в Федеральный закон от 6 октября 1999 года N 184-ФЗ "Об общих принципах организации законодательных (представительных) и исполнительных органов государственной власти субъектов Российской Федерации" в собственности субъекта Российской Федерации может находиться имущество, расположенное на территориях речных портов, необходимое для их содержания, развития и организации их эксплуатации за исключением видов имущества, перечень которых утверждается Правительством Российской Федерации. В настоящее время ведется работа по формированию указанного перечня.
На данном этапе развития государственного управления транспортным комплексом предполагается включить в Перечень имущества, расположенного на территориях речных портов, имущество, необходимое для исполнения функций и полномочий Российской Федерации по обеспечению безопасности судоходства и устойчивому функционированию отрасли в целом, которое не может находиться в собственности субъектов Российской Федерации:
объекты и сооружения, входящие в системы управления движением судов;
средства навигационного оборудования и другие объекты навигационно-гидрографического обеспечения;
объекты и средства автоматической идентификационной системы, единой службы контроля судоходства и управления судоходством;
оборудование технологической связи речного транспорта;
портовые гидротехнические сооружения и причалы, имеющие общегосударственное значение, в том числе обеспечивающие жизнедеятельность двух и более субъектов Российской Федерации.