До введения в действие главы Налогового кодекса Российской Федерации "Сборы за пользование объектами животного мира и за пользование объектами водных биологических ресурсов" платность за пользования объектами животного мира, отнесенными к объектам охоты, была определена Федеральным законом от 24 мая 1995 года N 52-ФЗ "О животном мире". Статьей 35 данного Закона было установлено, что пользование объектами животного мира с изъятием их из среды обитания предоставлялось за плату, размеры которой устанавливались органами исполнительной власти субъектов Российской Федерации в порядке и пределах, определяемых Правительством Российской Федерации. Предельные размеры платы за пользование объектами животного мира, отнесенными к объектам охоты, изъятие которых из среды их обитания без лицензии запрещено, были утверждены Постановлением Правительства Российской Федерации от 4 января 2000 года N 1 "О предельных размерах платы за пользование объектами животного мира, отнесенными к объектам охоты, изъятие которых их среды их обитания без лицензии запрещено". Предельные размеры платы за пользование отдельными видами водных биологических ресурсов были утверждены Постановлением Правительства Российской Федерации от 14 декабря 1998 года N 1490 "О мерах по усилению государственного управления водными биологическими ресурсами". Однако, порядок исчисления и уплаты указанных платежей не был определен.
Приказом Минфина России от 29 декабря 2000 года N 420 "О перечне налогов и сборов, подлежащих зачислению на балансовый счет N 40101 "Доходы распределяемые органами федерального казначейства между уровнями бюджетной системы Российской Федерации" платежи за пользование объектами животного мира, предусмотренные Федеральным законом от 23 мая 1995 года N 52-ФЗ "О животном мире" подлежали зачислению на балансовый счет N 40101 "Доходы, распределяемые органами федерального казначейства между уровнями бюджетной системы Российской Федерации" по статье 1050800 "Плата за право пользования объектами животного мира и водными биологическими ресурсами" Классификации доходов бюджетов Российской Федерации.
Поступление платежей за пользование водными биологическими ресурсами обеспечивалось путем продажи на специальных аукционах квот (лотов), дающих право на вылов определенного объема (порядка 50 % общего допустимого улова водных биологических ресурсов) конкретных видов рыб и других морских биоресурсов. Приказом Минэкономразвития России от 10 января 2001 года N 3 "Об организации обеспечения проведения аукционов по продаже промышленных квот на вылов (добычу) водных биологических ресурсов" утвержден Порядок проведения аукционов по продаже промышленных квот на вылов (добычу) водных биологических ресурсов. Остальная часть водных биоресурсов распределялась в пределах общего допустимого улова на безвозмездной основе.
В соответствии с Законом Российской Федерации от 27 декабря 1991 года N 2118-1 "Об основах налоговой системы в Российской Федерации" и Федеральным законом от 15 августа 1996 года N 115-ФЗ "О бюджетной классификации Российской Федерации" (в редакции от 8 августа 2001 года) в Классификации доходов бюджетов Российской Федерации плата за пользования объектами животного мира и водными биологическими ресурсами относилась к Федеральным налогам и входила как составная часть в раздел "Платежи за пользование природными ресурсами".
В целях установления на законодательном уровне платежей за пользование объектами животного мира и объектами водных биологических ресурсов был принят Федеральный закон от 11 ноября 2003 года N 148-ФЗ "О внесении изменений в часть вторую Налогового кодекса Российской Федерации и некоторые другие законодательные акты Российской Федерации", дополняющий Налоговый кодекс Российской Федерации главой 25.1 "Сборы за пользование объектами животного мира и за пользование объектами водных биологических ресурсов", который вступил в действие с 1 января 2004 года.
Главой установлены все необходимые элементы налогообложения как по сборам за пользование объектами животного мира, отнесенных к объектам охоты, так и по сборам за пользование объектами водных биологических ресурсов.