Планирование контрольных мероприятий в 1998 году осуществлялось на основании поручений Московской городской Думы (постановление Московской городской Думы от 26 ноября 1997 года N 85) и Мэра Москвы (письмо Мэра Москвы от 13 ноября 1997 года N 4-19-15474/7). Кроме этого, в план были включены отдельные мероприятия с целью обеспечения системного подхода и непрерывности контрольного процесса в соответствии с Законом о Палате.
В течение 1998 года на основании запросов комиссий и депутатов Московской городской Думы, Мэра Москвы, а также решения Коллегии Палаты от 28 января 1998 года N 1 "О проведении проверок расходования городских бюджетных и внебюджетных средств городскими инвесторами" в план мероприятий Палаты был включен ряд дополнительных проверок и обследований. Внесение дополнений и изменений в план контрольных мероприятий Палаты было принято постановлением Московской городской Думы от 14 декабря 1998 года N 110.
В связи с отсутствием предварительных поручений от Московской городской Думы и Мэра Москвы на проведение экспертно-аналитических работ, экспертно-аналитические работы проводились по распоряжениям председателя Палаты в соответствии с отдельными запросами бюджетно-финансовой комиссии и депутатов Московской городской Думы, а также в инициативном порядке.