В компетенцию федеральных органов государственной власти в исключительной экономической зоне входят:
1) разработка и совершенствование законодательства Российской Федерации об исключительной экономической зоне и о деятельности в ней;
2) координация деятельности органов государственной власти в отношении исключительной экономической зоны и деятельности в ней, защиты прав и законных интересов Российской Федерации в исключительной экономической зоне, защиты и сохранения морской среды, водных биоресурсов и неживых ресурсов (подпункт в редакции, введенной в действие с 7 февраля 2007 года Федеральным законом от 4 ноября 2006 года N 188-ФЗ; в редакции, введенной в действие с 9 января 2010 года Федеральным законом от 27 декабря 2009 года N 364-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
3) утверждение федеральных программ, связанных с разведкой, разработкой и сохранением природных ресурсов исключительной экономической зоны (подпункт в редакции, введенной в действие с 9 января 2010 года Федеральным законом от 27 декабря 2009 года N 364-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
4) подпункт утратил силу с 1 января 2008 года - Федеральный закон от 6 декабря 2007 года N 333-ФЗ - см. предыдущую редакцию;
5) установление порядка выдачи деклараций об уловах водных биоресурсов, выловленных (добытых) российскими и иностранными судами в исключительной экономической зоне, а также о произведенной из этих ресурсов продукции (подпункт в редакции, введенной в действие с 7 февраля 2007 года Федеральным законом от 4 ноября 2006 года N 188-ФЗ; в редакции, введенной в действие с 9 января 2010 года Федеральным законом от 27 декабря 2009 года N 364-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
6) установление порядка предоставления права на добычу (вылов) водных биоресурсов, в том числе выдачи разрешений на добычу (вылов) водных биоресурсов (подпункт в редакции, введенной в действие с 9 января 2010 года Федеральным законом от 27 декабря 2009 года N 364-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
7) установление ограничений рыболовства (подпункт в редакции, введенной в действие с 9 января 2010 года Федеральным законом от 27 декабря 2009 года N 364-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
8) разработка и внедрение системы наблюдения и контроля за рыболовством в исключительной экономической зоне, в том числе с использованием космических средств связи и радионавигации (подпункт в редакции, введенной в действие с 9 декабря 2008 года Федеральным законом от 3 декабря 2008 года N 250-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
9) разработка совместно с органами государственной власти субъектов Российской Федерации, территории которых прилегают к морскому побережью, мер по предотвращению гибели водных биоресурсов при осуществлении хозяйственной или иной деятельности и судоходства (подпункт в редакции, введенной в действие с 7 февраля 2007 года Федеральным законом от 4 ноября 2006 года N 188-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
10) оказание помощи водным биоресурсам, в том числе морским млекопитающим, в случае возникновения угрозы их жизни при стихийных бедствиях или вследствие иных причин (подпункт в редакции, введенной в действие с 7 февраля 2007 года Федеральным законом от 4 ноября 2006 года N 188-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
11) установление с учетом предложений органов исполнительной власти субъектов Российской Федерации, территории которых прилегают к морскому побережью, порядка использования неживых ресурсов, включая порядок лицензирования (подпункт в редакции, введенной в действие с 9 января 2010 года Федеральным законом от 27 декабря 2009 года N 364-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
12) регистрация работ по изучению, разведке и разработке неживых ресурсов, составление федерального баланса запасов неживых ресурсов;
13) федеральный государственный контроль (надзор) в области рыболовства и сохранения водных биоресурсов, защита и охрана морской среды, водных биоресурсов и неживых ресурсов с привлечением органов государственной власти субъектов Российской Федерации, территории которых прилегают к морскому побережью (подпункт в редакции, введенной в действие с 7 февраля 2007 года Федеральным законом от 4 ноября 2006 года N 188-ФЗ; в редакции, введенной в действие с 1 августа 2011 года Федеральным законом от 18 июля 2011 года N 242-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
14) регулирование проведения морских ресурсных и морских научных исследований (подпункт в редакции, введенной в действие с 9 января 2010 года Федеральным законом от 27 декабря 2009 года N 364-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
15) установление контрольных пунктов (точек) и порядка прохождения их российскими и иностранными судами, осуществляющими рыболовство и следующими в исключительную экономическую зону и выходящими из нее, в целях проведения контрольно-проверочных мероприятий (подпункт в редакции, введенной в действие с 7 февраля 2007 года Федеральным законом от 4 ноября 2006 года N 188-ФЗ; в редакции, введенной в действие с 9 декабря 2008 года Федеральным законом от 3 декабря 2008 года N 250-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
16) объявление отдельных районов исключительной экономической зоны районами, в пределах которых гражданам Российской Федерации и российским юридическим лицам, иностранным государствам и компетентным международным организациям, иностранным гражданам и иностранным юридическим лицам не будут выдаваться разрешения на проведение морских научных исследований в связи с ведением (или планированием ведения) в указанных районах работ по разведке и разработке неживых ресурсов и осуществлению рыболовства с сообщением географических координат таких районов в "Извещениях мореплавателям" (подпункт в редакции, введенной в действие с 7 февраля 2007 года Федеральным законом от 4 ноября 2006 года N 188-ФЗ; в редакции, введенной в действие с 9 декабря 2008 года Федеральным законом от 3 декабря 2008 года N 250-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
17) установление системы платежей, определение размеров, условий и порядка взимания платы за пользование водными биоресурсами и неживыми ресурсами (подпункт в редакции, введенной в действие с 1 января 2004 года Федеральным законом от 11 ноября 2003 года N 148-ФЗ; в редакции, введенной в действие с 9 января 2010 года Федеральным законом от 27 декабря 2009 года N 364-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
18) регулирование деятельности по созданию, эксплуатации и использованию искусственных островов, установок и сооружений в целях разведки и разработки природных ресурсов исключительной экономической зоны, проведения морских научных исследований и в иных целях (подпункт в редакции, введенной в действие с 26 апреля 2003 года Федеральным законом от 22 апреля 2003 года N 48-ФЗ; в редакции, введенной в действие с 7 февраля 2007 года Федеральным законом от 4 ноября 2006 года N 188-ФЗ; в редакции, введенной в действие с 9 декабря 2008 года Федеральным законом от 3 декабря 2008 года N 250-ФЗ; в редакции, введенной в действие с 9 января 2010 года Федеральным законом от 27 декабря 2009 года N 364-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
19) определение и регулирование условий прокладки подводных кабелей и трубопроводов, используемых для разведки и разработки неживых ресурсов или для эксплуатации искусственных островов, установок и сооружений, в том числе выводимых на территорию Российской Федерации;
20) определение трассы и условий прокладки подводных кабелей и трубопроводов в исключительной экономической зоне с учетом проложенных подводных кабелей и трубопроводов и с учетом деятельности по разведке и разработке природных ресурсов исключительной экономической зоны (подпункт в редакции, введенной в действие с 9 декабря 2008 года Федеральным законом от 3 декабря 2008 года N 250-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
21) проведение государственной экологической экспертизы, федерального государственного экологического контроля (надзора) и государственного мониторинга исключительной экономической зоны с привлечением органов исполнительной власти субъектов Российской Федерации, территории которых прилегают к морскому побережью;
(Подпункт в редакции, введенной в действие с 9 января 2010 года Федеральным законом от 27 декабря 2009 года N 364-ФЗ; в редакции, введенной в действие с 1 августа 2011 года Федеральным законом от 18 июля 2011 года N 242-ФЗ; в редакции, введенной в действие с 1 июля 2021 года Федеральным законом от 11 июня 2021 года N 170-ФЗ. - См. предыдущую редакцию)
22) ведение Российского государственного фонда данных о состоянии исключительной экономической зоны и состоянии ее водных биоресурсов и неживых ресурсов (подпункт в редакции, введенной в действие с 7 февраля 2007 года Федеральным законом от 4 ноября 2006 года N 188-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
23) установление правового режима в зонах чрезвычайных экологических ситуаций и экологического бедствия; обеспечение немедленных действий по ликвидации последствий аварий, приводящих к загрязнению нефтью или веществами, иными, чем нефть;
24) установление экологических нормативов содержания загрязняющих веществ в сбросах вредных веществ, а также в отходах и других материалах, предназначенных к захоронению в исключительной экономической зоне, перечня вредных веществ, отходов и других материалов, сброс и захоронение которых в исключительной экономической зоне запрещены, регулирование сброса вредных веществ и захоронения отходов и других материалов, а также контроль за указанными сбросом и захоронением (подпункт в редакции, введенной в действие с 9 января 2010 года Федеральным законом от 27 декабря 2009 года N 364-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
25) охрана редких и находящихся под угрозой исчезновения видов водных биоресурсов, занесенных в Красную книгу Российской Федерации, предотвращение нарушения среды их обитания (в том числе условий нагула, зимовки, размножения, нереста и миграции), образование государственных природных заповедников, национальных парков, государственных природных заказников и других особо охраняемых природных территорий, включая примыкающие к зонам отдыха на побережье Российской Федерации, о чем сообщается в "Извещениях мореплавателям" (подпункт в редакции, введенной в действие с 9 января 2010 года Федеральным законом от 27 декабря 2009 года N 364-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
26) обеспечение совместно с органами государственной власти субъектов Российской Федерации выполнения мероприятий, направленных на охрану исключительной экономической зоны, защиту и сохранение ее морской среды, водных биоресурсов и неживых ресурсов, пресечение нарушений настоящего Федерального закона и международных договоров Российской Федерации и привлечение к ответственности лиц, виновных в совершении противоправных действий (подпункт в редакции, введенной в действие с 7 февраля 2007 года Федеральным законом от 4 ноября 2006 года N 188-ФЗ; в редакции, введенной в действие с 9 января 2010 года Федеральным законом от 27 декабря 2009 года N 364-ФЗ, - см. предыдущую редакцию);
27) разрешение споров в отношении исключительной экономической зоны и деятельности в ней;