Разработка МЭС Санкт-Петербурга включает: формирование рабочей группы, разработку регламента деятельности рабочей группы, обучение членов рабочей группы, формирование клинико-экономической матрицы и текста (требований, содержательной части), корректировку МЭС, передачу МЭС с протоколом на экспертизу.
Научно-методическую координацию рабочих групп по разным профилям патологии осуществляет структурное подразделение учреждения, уполномоченного Комитетом по здравоохранению (далее - структурное подразделение).
Порядок формирования и регламент деятельности рабочих групп устанавливается отдельным распоряжением Комитета по здравоохранению.