Программа наиболее тесно взаимосвязана с региональной целевой программой "Водоохранные и водохозяйственные работы Ленинградской области" (строительство канализационных очистных сооружений, сохранение качества поверхностных и грунтовых вод, обеспечение населения питьевой водой), которую также курирует комитет по природным ресурсам и охране окружающей среды Ленинградской области.