Программно-целевые установки, отраженные в Стратегии 2035, реализуются в подпрограммах.
Подпрограммы имеют следующие цели:
обеспечение благоприятного состояния окружающей среды, сохранение естественных экологических систем и природных ресурсов и обеспечение экологической безопасности Санкт-Петербурга (подпрограмма 1);
повышение эффективности использования, охраны, защиты и воспроизводства зеленых насаждений Санкт-Петербурга для сохранения благоприятной окружающей среды и условий жизнедеятельности населения (подпрограмма 2);
улучшение экологической обстановки в Санкт-Петербурге (подпрограмма 3);
обеспечение стабильной и благополучной эпизоотической обстановки на территории Санкт-Петербурга и безопасности продуктов животноводства, выпускаемых на потребительский рынок, в ветеринарно-санитарном отношении (подпрограмма 4);
повышение уровня благоустройства, комфортности и безопасности городской среды (подпрограмма 5).
Выделение подпрограмм обосновывается необходимостью минимизации числа соисполнителей государственной программы, привлекаемых для решения ее конкретных задач и определения ИОГВ, ответственных за достижение конечных значений целевых показателей государственной программы.