Воздушный транспорт в Сахалинской области используется преимущественно для перевозки пассажиров на дальние расстояния и в труднодоступные местности, в том числе на Курильские острова.
В межнавигационный период на отдельных направлениях авиация является единственным средством транспортного сообщения.
Доля воздушного транспорта в грузообороте Сахалина незначительна - менее 1%.
В настоящее время большинство региональных (внутриобластных) воздушных перевозок дотируется из областного бюджета.
На территории Сахалинской области имеются 7 аэропортов: ФГУП "Аэропорт Южно-Сахалинск", ОАО "Сахалинский аэропорт Оха", ГУП "Аэропорт Южно-Курильск", ОАО "Аэропорт Шахтерск", ОАО "Аэропорт Ноглики", ОАО "Авиапредприятие Зональное" (Тымовский район, п. Зональное) и МАП "Буревестник" (о. Итуруп), а также вертодром в г. Северо-Курильске (о. Парамушир).
ФГУП "Аэропорт Южно-Сахалинск" является аэропортом федерального значения, с 1990 года имеет статус международного аэропорта, включен в перечень стратегических предприятий.