Общий контроль за реализацией государственной программы осуществляет заместитель Губернатора Томской области по агропромышленной политике и природопользованию. Текущий контроль и мониторинг реализации государственной программы осуществляют Департамент потребительского рынка Администрации Томской области и соисполнители государственной программы.
Департамент потребительского рынка Администрации Томской области представляет в Департамент экономики Администрации Томской области отчеты о реализации мероприятий в соответствии с постановлением Администрации Томской области от 22.06.2012 № 237а «О государственных программах Томской области».
(Абзац в редакции постановления Администрации Томской области от 24 декабря 2014 года № 514а, - см. предыдущую редакцию)