Основными задачами координационного Совета являются:
содействие реализации полномочий Президента Республики Башкортостан по вопросам обеспечения согласованного функционирования, координации деятельности и организации взаимодействия органов исполнительной власти Республики Башкортостан, территориальных органов федеральных органов исполнительной власти и органов местного самоуправления в Республике Башкортостан;
обсуждение особо значимых вопросов общественно-политического и социально-экономического развития Республики Башкортостан, в реализации которых совместно с органами исполнительной власти Республики Башкортостан участвуют территориальные органы федеральных органов исполнительной власти и органы местного самоуправления в Республике Башкортостан;
планирование и реализация совместных мероприятий, а также рассмотрение при необходимости их результатов;
обсуждение вопросов исполнения органами исполнительной власти Республики Башкортостан, территориальными органами федеральных органов исполнительной власти, органами местного самоуправления в Республике Башкортостан, их должностными лицами Конституции Российской Федерации, Конституции Республики Башкортостан, федеральных законов, указов и распоряжений Президента Российской Федерации, законов Республики Башкортостан, указов и распоряжений Президента Республики Башкортостан, иных федеральных и республиканских нормативных правовых актов;
рассмотрение по предложению Президента Республики Башкортостан проектов законов Республики Башкортостан и проектов указов Президента Республики Башкортостан, затрагивающих вопросы взаимодействия органов исполнительной власти Республики Башкортостан, территориальных органов федеральных органов исполнительной власти и органов местного самоуправления в Республике Башкортостан;
рассмотрение особо важных проблем осуществления взаимодействия органов исполнительной власти Республики Башкортостан, территориальных органов федеральных органов исполнительной власти и органов местного самоуправления в Республике Башкортостан, в том числе возникающих в процессе урегулирования разногласий, по которым между сторонами не достигнуто согласия;
обмен информацией, необходимой для реализации полномочий государственных и муниципальных органов;
рассмотрение и обсуждение по предложению Президента Республики Башкортостан иных вопросов, имеющих особое значение и требующих согласованного решения.