Существующий в ОАО ЛОРП природоохранный флот (9 ед., средний возраст - 33 года) выработал свой нормативный срок службы (20 лет) и не отвечает современным требованиям по защите окружающей среды, установленным Водным кодексом Российской федерации. Этот флот является государственной собственностью, переданной ОАО ЛОРП в оперативное управление. Его развитие должно финансироваться из бюджета (в соответствии с распоряжением Комитета РФ по управлению государственным имуществом от 16.09.1992 N 444-р и постановлением Правительства Республики Саха (Якутия) от 26.11.1993 N 504 флот специального назначения, включая природоохранные суда, не подлежит акционированию и приватизации).
Транспортный флот не может выполнять свои задачи без технических средств по утилизации судовых отходов. Для обеспечения его работы требуются:
самоходные судна комплексной переработки отходов (ССКПО) пр. 164М-6е (на Яну, на Индигирку, на Лену - в Жатай, Пеледуй, Олекминск, Тикси);
комплекс по зачистке наливного флота от нефтепродуктов в Пеледуе.