В региональном агропромышленном комплексе (АПК) важно не только сохранить территориальные преимущества и национальный колорит, но и перейти на качественно новый уровень развития.
Основными проблемами развития агропромышленного комплекса и рыбного хозяйства являются:
неблагоприятные общие условия функционирования сельского хозяйства, прежде всего диспаритет цен на сельскохозяйственную продукцию и материально-технические ресурсы, используемые в сельхозпроизводстве, неудовлетворительный уровень развития рыночной инфраструктуры;
низкие темпы структурно-технологической модернизации отрасли, обновления основных производственных фондов;
отсутствие необходимой транспортной и логистической инфраструктуры, учитывающей сбор, вывоз, реализацию продукции сельского хозяйства;
дефицит квалифицированных кадров, вызванный низким уровнем и качеством жизни в сельской местности;
возрастающее индустриальное освоение региона, введение новых масштабных месторождений на наиболее важных участках воспроизводства сиговых рыб (Обская и Тазовская губы, уральские притоки, верховья реки Таз), способствующее сокращению популяции ценных пород рыб в Обском бассейне;
отсутствие единой системы глубокой переработки и сбыта продукции традиционного хозяйства, что значительно снижает ценовую конкурентоспособность традиционных отраслей.