Основными функциями ГИС ЕСГФК являются:
обеспечение возможности размещения информации об осуществлении государственного (муниципального) финансового аудита (контроля) зарегистрированным представителям участников;
предоставление доступа пользователям и зарегистрированным представителям участников к информации об осуществлении государственного (муниципального) финансового аудита (контроля), размещенной в ГИС ЕСГФК;
ведение и обеспечение использования классификаторов и справочников, предусмотренных Регламентом, при размещении информации в ГИС ЕСГФК;
обеспечение регистрации представителей участников ГИС ЕСГФК;
информационное взаимодействие ГИС ЕСГФК с иными информационными системами в целях получения информации, необходимой для размещения в ГИС ЕСГФК, а также предоставления информации, содержащейся в ГИС ЕСГФК;
предоставление возможности анализа информации, размещенной в ГИС ЕСГФК.