Модель финансового обеспечения программы развития предполагает реализацию программы развития на основе государственно-частного партнерства.
Финансовая оценка затрат на реализацию программы развития не включает расходы на текущее функционирование университета, а также средства, направляемые на реконструкцию и строительство объектов для университета в рамках федеральной целевой программы "Социально-экономическое развитие Республики Крым и г.Севастополя до 2020 года", утвержденной постановлением Правительства Российской Федерации от 11 августа 2014 года N 790 "Об утверждении федеральной целевой программы "Социально-экономическое развитие Республики Крым и г.Севастополя до 2020 года".
Общий объем финансового обеспечения программы развития составит в 2016-2025 годах 3064 млн. рублей, из них средства федерального бюджета в 2016-2020 годах - 2500 млн. рублей. Внебюджетное финансирование мероприятий программы развития осуществляется за счет средств университета от приносящей доход деятельности, преимущественно полученных от научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ, и составит в 2018-2025 годах 564 млн. рублей.