- Консолидация и концентрация ресурсов на перспективных научно-технологических направлениях на основе расширения применения механизмов государственно-частного партнерства;
- Содействие развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере, их интеграции в систему научно-технической кооперации;
- Развитие научной приборной базы конкурентоспособных научных организаций, и высших учебных заведений, ведущих фундаментальные и прикладные исследования;
- Развитие исследовательской деятельности в высших учебных заведениях;
- Создание на базе вузов и крупных институтов инновационно-технологических центров, обеспечивающих внедрение полученных результатов прикладных исследований;
- Проведение исследований с использованием уникальных стендов и установок, а также уникальных объектов научной инфраструктуры (включая обсерватории, ботанические сады, научные музеи и др.) в научных организациях и образовательных учреждениях высшего профессионального образования;
- Развитие системы демонстрации новых достижений и трансферта передового опыта по проблемам развития науки и инноваций на основе проведения регулярных и постоянно действующих выставочных и конгрессных мероприятий, обеспечивающих презентацию и коммерциализацию новой научно-технической продукции московских организаций;
- Развитие высокотехнологичных, инновационных направлений отрасли науки и ее структурное реформирование;
- Реализация "Программы модернизации структуры, функций и механизмов финансирования Российской академии наук, Российской академии образования, Российской академии медицинских наук, Российской академии сельскохозяйственных наук, Российской академии архитектуры и строительных наук, Российской академии художеств";
- Реформирование оборонного комплекса и его отдельных отраслей в рамках Федеральной целевой программы "Национальная технологическая база на 2007-2011 годы";
- Усиление инновационных компонентов экономического роста на основе реализации пакета институциональных преобразований и системы национальных проектов в рамках президентских инициатив и долгосрочных стратегий развития ключевых секторов экономики;
- Перенос приоритетов в высокотехнологичные отрасли, увеличение финансирования на проведение прикладных исследований и выполнение разработок отраслевого характера;
- Изменение в соотношении источников финансирования научных исследований в Москве: сокращение доли средств, поступающих из бюджета за счет более интенсивного прироста финансирования из средств предпринимательского сектора и увеличения затрат на науку из собственных средств организаций;
- Реализация программы по созданию интегрированных научно-производственных комплексов на основе кластерных систем с замкнутым циклом;
- Обеспечение притока молодых специалистов в сферу исследований и разработок, развитие ведущих научных школ.