Основным исполнительно-координирующим органом реализации Комплексных мероприятий является Комитет межрегиональных связей и национальной политики города Москвы - уполномоченный орган исполнительной власти города Москвы по осуществлению межрегионального сотрудничества.
Эффективное выполнение системы Комплексных мероприятий возможно при условии активного взаимодействия отраслевых и территориальных органов исполнительной власти города Москвы, других государственных и общественных учреждений и организаций, хозяйствующих субъектов, участвующих в пределах своей компетенции в выполнении мероприятий, а именно:
- Московского городского координационнного совета по межрегиональному сотрудничеству,
- Департамента градостроительной политики, развития и реконструкции города Москвы,
- Департамента здравоохранения города Москвы,
- Департамента науки и промышленной политики города Москвы,
- Департамента образования города Москвы,
- Департамента поддержки и развития малого предпринимательства города Москвы,
- Департамента потребительского рынка и услуг города Москвы,
- Департамента природопользования и охраны окружающей среды города Москвы,
- Департамента продовольственных ресурсов города Москвы,
- Департамента социальной защиты города Москвы,
- Комитета по делам семьи и молодежи города Москвы,
- Комитета по культуре города Москвы,
- Комитета общественных связей города Москвы,
- Комитета по туризму города Москвы,
- Комитета города Москвы по телекоммуникациям и средствам массовой информации,
- Комитета физической культуры и спорта города Москвы,
- Комитета транспорта и связи города Москвы,
- префектур административных округов города Москвы,
- Московского городского координационнного совета региональных землячеств,
- Московского банковского союза,
- Московской торгово-промышленной палаты и других заинтересованных организаций.
Отраслевые и территориальные органы исполнительной власти города Москвы, участвующие в рамках своей компетенции в реализации Комплексных мероприятий, на регулярной основе представляют в Комитет межрегиональных связей и национальной политики города Москвы отчеты о выполнении мероприятий, исполнителями которых они являются.
Успешная реализация задач межрегионального сотрудничества предполагает активное взаимодействие отраслевых и территориальных органов исполнительной власти города Москвы с общественными организациями, фондами и другими учреждениями, занимающимися проблемами развития межрегионального сотрудничества, использование возможностей негосударственных организаций, привлекая их на конкурсной основе к реализации Комплексных мероприятий.
При решении задач усиления координации деятельности участников межрегионального сотрудничества, повышения отдачи от реализации Комплексных мероприятий, оперативного мониторинга ситуации и выработки новых подходов в данной области особенно возрастает роль Московского городского координационного совета по межрегиональному сотрудничеству.
Эффективная координация хода межрегионального сотрудничества предполагает задействование трех уровней городской администрации Москвы: городского, окружного и районного. Для этого необходимо создать Советы по межрегиональному сотрудничеству при префектурах и управах. Руководители окружных Советов включаются в состав Московского городского координационного совета по межрегиональному сотрудничеству.
Для эффективной деятельности по управлению и координации выполнения Комплексных мероприятий по дальнейшему развитию межрегионального сотрудничества города Москвы на 2004-2006 годы Комитет межрегиональных связей и национальной политики города Москвы должен активизировать и повысить качество работы по вопросам экспертно-экономического обеспечения межрегионального сотрудничества в соответствии с Законом города Москвы "О договорах и соглашениях города Москвы", а также распорядительных документов о порядке его реализации, в частности: разработке, согласовании, заключении и контроле выполнения межрегиональных соглашений, договоров, комплексных проектов и программ, оценке финансово-экономического обоснования инициативных проектов.