МР 4.2.0020-11
МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
4.2. МЕТОДЫ КОНТРОЛЯ. БИОЛОГИЧЕСКИЕ И МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЕ ФАКТОРЫ
Фенотипическая идентификация бактерий рода
Дата введения: с момента утверждения
1. РАЗРАБОТАНЫ НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, г.Санкт-Петербург (Г.Я.Ценева - заслуженный деятель науки РФ, доктор медицинских наук, профессор, Л.А.Краева - кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник); Харьковской медицинской академией последипломного обучения (Ж.Н.Манина - кандидат медицинских наук, доцент); Институтом экспериментальной и клинической ветеринарной медицины, г.Харьков (О.В.Шаповалова - кандидат биологических наук, С.В.Бирюкова - доктор медицинских наук, профессор); Федеральной службой по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (Ю.В.Демина - кандидат медицинских наук, заместитель начальника управления эпидемиологического надзора).
2. УТВЕРЖДЕНЫ Руководителем Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, Главным государственным санитарным врачом Российской Федерации Г.Г.Онищенко 11 мая 2011 г.
3. ВВЕДЕНЫ ВПЕРВЫЕ.
В методических рекомендациях представлены современные сведения о таксономии, биологических особенностях и роли коринебактерий в патологии человека и животных. Основное внимание уделяется методам фенотипической идентификации и дифференциальной диагностики представителей рода Corynebacterium от других грамположительных палочковидных бактерий, в т.ч. С. diphtheriae, имеющих клиническое значение. Приведенные адаптированные диагностические таблицы и методики приготовления необходимых питательных сред и реагентов рекомендуются для практического применения в лабораториях клинической и ветеринарной микробиологии.
Коринебактерии часто встречаются во внешней среде и обычно колонизируют кожу и слизистые оболочки человека и животных, являясь представителями микроценозов данных биотопов. Роль этих микроорганизмов в развитии заболеваний человека и животных установлена недавно. В зависимости от биологических особенностей разные виды коринебактерий способны поражать кожу и внутренние органы, особенно у пожилых людей, пациентов с иммуносупрессией или мультиорганной патологией. В случаях инфицирования венозных или брюшных катетеров, нейрохирургических шунтов наблюдается бактериемия. Многие представители коринебактерий становятся причиной эндокардитов, пневмоний, септического артрита и остеомиелита, инфекций при протезировании, заболеваний мочеполовой системы. В связи с этим в клинической практике необходима точная идентификация бактерий данной группы, что позволит правильно и своевременно выбрать этиотропную терапию. Однако в настоящее время фенотипическая идентификация большинства видов коринебактерий затруднена из-за отсутствия информативных диагностических схем и таблиц, а также из-за дефицита оперативных сведений о роли их в патологии человека и животных.
Определяющий вклад в успешную идентификацию коринебактерий внесли автоматизированные и полуавтоматизированные системы, методы родовой и видовой идентификации на основе анализа 16S рРНК. К сожалению, использование сложных и дорогостоящих хемотаксономических исследований, проведение молекулярно-генетического анализа доступно малому числу лабораторий. В практической работе в основном применяются традиционные, общепринятые, "пробирочные" тесты. Кроме того, эти тесты незаменимы, когда идет проверка диагностической эффективности новых тест-систем. В этих случаях рутинные тесты, как "золотой стандарт", помогают решать многие спорные вопросы нетрадиционных методов идентификации возбудителей инфекционных заболеваний.
В настоящее время род Corynebacterium насчитывает 40 медицински значимых видов (и две таксонные группы). Традиционно основой их идентификации и дифференциации является метаболический профиль. Выявление фенотипических особенностей коринебактерий проводится на основе определения наличия или отсутствия сахаролитических энзимов и других ферментных систем. Однако вследствие морфологических и биохимических особенностей коринебактерий их идентификация нередко затруднена. Для получения достоверных сведений о характеристике вида становится необходимым использование наиболее информативных биохимических тестов и качественных питательных сред.
В рекомендациях представлены сведения о наиболее значимых видах коринеформных грамположительных палочек и их роли в патологии человека и животных. Помимо прописей питательных сред и необходимых комментариев по их использованию, приводятся оптимальные схемы их биохимической идентификации с минимальным и наиболее информативным набором тестов. Многие из этих методов характеризуются достаточно высокой воспроизводимостью, точностью, быстротой выполнения и приемлемой стоимостью.
В методических рекомендациях обобщены данные литературы, собственный опыт работы и опыт практических бактериологических лабораторий по морфологической и биохимической идентификации микроорганизмов рода Corynebacterium.
Дифференцирование коринебактерий следует проводить в соответствии с приведенным ниже перечнем биохимических признаков во избежание гипо- и гипердиагностики заболеваний, которые они вызывают.
Противопоказаний нет.
Оборудование
Весы лабораторные общего назначения 2-го класса точности | ГОСТ 24104-80* Е | |
________________ * На территории Российской Федерации документ не действует. Действует ГОСТ Р 53228-2008, здесь и далее по тексту. - Примечание изготовителя базы данных. | ||
Весы лабораторные 4-го класса точности с наибольшим пределом взвешивания 1000 г | ||
Ионометр универсальный ЭВ-74 или потенциометр рН-340 | ||
ОБМ-150 или других марок | ТУ 16-535-84 | |
Термостат, позволяющий поддерживать температуру 15-65 °С с отклонением от заданной 1 °С | ТУ 64-1-1382-72 | |
Шкаф сушильный стерилизационный ШСС-80П или других марок, позволяющий поддерживать температуру (160±5) °С | ТУ 64-1-9009-74 | |
Холодильник электрический бытовой | ||
Микроскоп световой биологический с увеличением 900-1000 | ГОСТ 8284* | |
______________ * На территории Российской Федерации документ не действует. Действуют ТУ 3-3.404-83, ТУ 3-3.190-80, ТУ 3-3.193-80, ТУ 3-3.986-81. - Примечание изготовителя базы данных. | ||
Автоклав вертикальный | ГОСТ 9586* | |
______________ * На территории Российской Федерации документ не действует. Действуют ТУ 27-31-2939-80. - Примечание изготовителя базы данных. | ||
Лупа с увеличением 5-10 | ГОСТ 8309* | |
_______________ * На территории Российской Федерации документ не действует. Действует ГОСТ 25706-83. - Примечание изготовителя базы данных. | ||
Термометр (ртутный) с диапазоном измерения от 0 до 100 °С | ||
Материалы | ||
Стекла предметные | ||
Стекла предметные для микроскопов | ||
Стекла покровные, 2 уп. | ||
Пинцет медицинский | ГОСТ 212241* | |
_______________ * Вероятно ошибка оригинала. Следует читать: ГОСТ 21241. - Примечание изготовителя базы данных. | ||
Скальпель медицинский | ||
Ножницы медицинские | ||
Часы песочные на 1, 2 и 5 мин | ГОСТ 10576 | |
Чашки Петри | ||
Спиртовки СЛ-1 | ||
Ступки фарфоровые с пестиком | ||
Пробирки стеклянные бактериологические П2-10-90ХС; П3-5ХС | ||
Пробирки для микропроб однократного применения (пробирки Эппендорфа) | ТУ 64-2-300-80 | |
Пипетки 7-1-1; 7-1-2; 7-1-5; 7-1-10; 8-2-0,1 | ГОСТ 20292* | |
________________ * На территории Российской Федерации документ не действует. Действуют ГОСТ 29169-91, ГОСТ 29227-91 - ГОСТ 29229-91, ГОСТ 29251-91 - ГОСТ 29253-91. - Примечание изготовителя базы данных. | ||
Пипетки исполнения 5, 1-го, 2-го классов точности | ||
Стаканы В-1-250 ТС; Н-2-100 ТХС | ||
Колбы К-2-250-34 ТХС; П-2-250-34 ТХС | ||
Воронки стеклянные | ||
Бутылки стеклянные для химических реактивов | ||
Кастрюли эмалированные | ||
________________ * Текст документа соответствует оригиналу. - Примечание изготовителя базы данных. | ||
Цилиндры 2-100; 4-100; 4-25 | ||
Марля медицинская | ||
Воронки В-36-80ХС; ВФ-1-75ХС | ГОСТ 25236 | |
Вата медицинская гигроскопическая | ||
Бумага фильтровальная лабораторная | ||
Бумага парафинированная | ||
Реактивы и питательные среды | ||
Вода дистиллированная | ||
Спирт этиловый ректификованный | ||
Агар микробиологический | ||
Глюкоза, хч | ||
Мясо-пептонный бульон | ||
Масло иммерсионное | ||
Мочевина, хч | ||
Глицерин, хч | ||
Мел химический осажденный | ||
Глюкоза кристаллическая, хч | ||
Пептон сухой ферментативный | ||
Масло вазелиновое медицинское | ||
Натрий хлористый, хч | ||
Натрий двууглекислый | ||
Натрий фосфорно-кислый однозамещенный, чда | ||
Натрий фосфорно-кислый двузамещенный безводный, чда | ||
Калий фосфорно-кислый однозамещенный, чда | ||
Калий фосфорно-кислый двузамещенный, чда | ||
Сахароза, хч | ||
Йод | ||
Натрий гидроокись | ||
Соль Мора |
Коринеформные бактерии - плеоморфные палочковидные грамположительные микроорганизмы, относящиеся к классу Actinobacteria, объединенные по 16S рРНК. Проведенные хемотаксономические исследования позволили найти общие черты среди коринеформных бактерий в целом, а также дифференцировать между собой отдельных их представителей. Многие из них представляют интерес для медицины и ветеринарии. Термин "коринеформные" связан с плеоморфной палочковидной формой этих грамположительных бактерий. Термин "дифтероиды" в последнее время не употребляется, т.к. большинство видов не имеют сходства с Corynebacterium diphtheriae - основным патогенным микроорганизмом группы.