Все водозаборы поверхностных вод расположены на селитебной территории ниже выпусков хозяйственно бытовых стоков ОСК «Красная речка» и др. объектов, а также сбросов неочищенных поверхностных вод. Все водозаборные сооружения подвержены высокой заносимости песчаными отложениями и шугой, требуется регулярное водолазное обслуживание, дноуглубительные работы, строительство защитных оградительных сооружений и других дорогостоящих работ. В последние годы наблюдается катастрофическое загрязнение р. Амур, привносимое с залповыми сбросами со стороны КНР и «попуски» воды из водохранилищ Зейской и Бурейской ТЭС особенно в период низких уровней воды в р. Амур.
Качество воды, поступающей потребителям, по органолептическим и другим показателям (содержание железа, марганца, остаточного хлора) не всегда отвечает требованиям СанПиН 2.1.4.1074-01«Питьевая вода. Гигиенические требования к качеству воды централизованных систем питьевого водоснабжения. Контроль качества».
Водоводы и уличные разводящие сети в основной массе построены в 60 - 70-х годах, 50% их имеет износ 80 - 100% и требуют замены. В таких трубопроводах происходит вторичное загрязнение воды.
Очистные сооружения ГОСВ, особенно первый блок, требуют срочной реконструкции, в связи с аварийным состоянием железобетонных конструкций, и модернизации технологического комплекса очистки воды.
Производительность ВНС 3-го подъема «Лермонтова» недостаточна для водообеспечения потребностей населения данной зоны. В работе станции задействованы 3 насоса с суммарной производительностью 3750 куб. м/час. Согласно норм СНиП нарушаются требования по резерву оборудования.
Во многих районах города разводящие сети малой пропускной способности, диаметр их не превышает 300 мм. Эта проблема большей частью выражена в зоне СНС, в связи, с чем развитие нового строительства в этой зоне приостановлено.
Одной из проблем города является переход с «открытой» системы горячего водоснабжения на «закрытую».
Система горячего водоснабжения в городе - «открытого типа», что приводит к значительным водопотерям и энергозатратам.
Ряд районов города обеспечиваются водой от ведомственных водозаборов: ст. Хабаровск-1 производительностью 7000 куб. м/сут., ст. Амур - 9000 куб. м/сут., качество подаваемой воды потребителям, не отвечает требованиям СанПиН 2.1.4.1074-01 «Питьевая вода».