Для подготовки КЭС и координации работ по его внедрению создается Рабочая группа, которая ответственна за формирование КЭС, их внедрение и мониторирование.
Деятельность Рабочей группы определяется Положением, которое определяет цели, задачи, принципы и порядок ее деятельности. Положение о деятельности Рабочей группы, списочный состав, ответственные исполнители по каждому клиническому направлению утверждаются приказом министерства здравоохранения края.
Все заседания Рабочей группы протоколируются.
На каждый КЭС заводится специальная папка (файл), куда заносится вся информация (изменения и дополнения) по разрабатываемому КЭС. После завершения разработки КЭС файл направляется в архив Рабочей группы.