Общее управление реализацией Основных направлений осуществляет министерство сельского хозяйства края.
Ежегодно министерство сельского хозяйства края совместно с Хабаровским краевым комитетом государственной статистики с участием заинтересованных министерств, комитетов и органов местного самоуправления подготавливает и до 1 февраля представляет Губернатору Хабаровского края доклад о ходе реализации Основных направлений за прошедший год.
Министерство сельского хозяйства края:
обеспечивает согласованность действий по подготовке и реализации мероприятий, целевому и эффективному использованию средств федерального бюджета, выполнению соглашений с Министерством сельского хозяйства Российской Федерации о финансировании мероприятий за счет средств бюджетов края и внебюджетных источников;
осуществляет взаимодействие с заказчиками, ответственными за выполнение мероприятий.