К задачам Штаба относятся:
2.1. Разработка мер по предупреждению возникновения заразных и массовых незаразных болезней животных и их ликвидации на территории автономного округа.
2.2. Обеспечение эффективного взаимодействия и координации деятельности исполнительных органов государственной власти Ханты-Мансийского автономного округа - Югры, юридических лиц, индивидуальных предпринимателей и граждан при предупреждении возникновения и ликвидации очагов заразных и массовых незаразных болезней животных.
2.3. Взаимодействие деятельности штабов при главах муниципальных образований Ханты-Мансийского автономного округа - Югры, оказание им необходимой помощи в выполнении мероприятий, направленных на предупреждение возникновения и ликвидацию очагов заразных и массовых незаразных болезней животных.
2.4. Подготовка и внесение на рассмотрение Председателя Правительства Ханты-Мансийского автономного округа - Югры предложений по вопросам совершенствования правового регулирования в сфере предупреждения заразных и массовых незаразных болезней животных, обеспечения ветеринарно-санитарного и эпизоотического благополучия в Ханты-Мансийском автономном округе - Югре.