Расходы на осуществление городом Ханты-Мансийском функций административного центра автономного округа финансируются за счет средств бюджета автономного округа в форме дотации. Объем средств, предназначенных на финансирование расходов для осуществления городом Ханты-Мансийском функций административного центра автономного округа, предусматривается отдельной статьей в законе автономного округа о бюджете автономного округа на очередной финансовый год и не учитывается при определении бюджетной обеспеченности города Ханты-Мансийска в целях бюджетного регулирования.
При формировании проекта бюджета автономного округа на очередной финансовый год уполномоченный орган местного самоуправления города в установленный бюджетным законодательством срок представляет в Правительство Ханты-Мансийского автономного округа - Югры обоснование расходов города Ханты-Мансийска на осуществление городом Ханты-Мансийском функций административного центра автономного округа и их объемы по направлениям расходования средств.
После утверждения объема дотации на осуществление городом Ханты-Мансийском функций административного центра автономного округа законом о бюджете автономного округа на очередной финансовый год представительный орган муниципального образования город Ханты-Мансийск утверждает распределение данных средств по направлениям расходования.
Одновременно с квартальными и годовыми отчетами об исполнении бюджета города Ханты-Мансийска уполномоченный орган местного самоуправления города представляет в Правительство Ханты-Мансийского автономного округа - Югры информацию об использовании выделенных средств из бюджета автономного округа.
В случае необходимости законом автономного округа о бюджете автономного округа на очередной финансовый год могут быть установлены иные формы финансирования расходов города Ханты-Мансийска в связи с осуществлением им функций административного центра автономного округа.