Уполномоченный орган проводит отбор проблем для программной разработки на основе:
материалов Концепции и прогнозов социально-экономического развития автономного округа и других документов стратегического развития;
анализа складывающейся социально-экономической ситуации в автономном округе;
значимости проблем для экономики автономного округа в целом и отдельных ее отраслей;
необходимости межведомственной координации для решения проблем;
Программы социально-экономического развития Ханты-Мансийского автономного округа - Югры (при разработке целевых программ).