Полномочиями Правительства в сфере здравоохранения являются:
участие в проведении единой государственной политики в области здравоохранения;
участие в создании условий для удовлетворения потребности населения и лечебно-профилактических учреждений в лекарственных средствах, предметах медицинского назначения в соответствии с федеральным законодательством и законами автономного округа;
создание системы лечебных, профилактических медицинских учреждений для удовлетворения потребности населения в медицинских услугах в соответствии с федеральным законодательством и законами автономного округа;
принятие решений в пределах своей компетенции по обеспечению контроля за соблюдением гарантированного уровня бесплатной и льготной лекарственной и медицинской помощи населению;
осуществление контроля за деятельностью, лицензирование и аккредитация фармацевтических и медицинских учреждений;
иные полномочия в области здравоохранения, определенные федеральным законодательством и законодательством автономного округа.