Основными функциями Комитета являются:
-участие в разработке единой государственной политики возрождения и развития российского казачества, традиционных форм его самоуправления, исходя из исторических традиций и современных потребностей государства, и создание условий для ее реализации;
-организация деятельности созданных на территории Ханты-Мансийского автономного округа хуторских, станичных, городских казачьих обществ, включенных в Государственный реестр казачьих обществ (далее именуется - казачьи общества), по подготовке и при-влечению их членов к государственной и иной службе, координация этой деятельности;
-разработка и реализация программ государственной поддержки казачьих обществ.