Совет выполняет следующие функции:
3.1. Изучение и разработка рекомендаций по совершенствованию управления особо охраняемыми природными территориями, а также формирование общественного мнения в целях поддержки предлагаемых в этой области решений.
3.2. Изучение и подготовка рекомендаций по землепользованию на территории особо охраняемых природных территориях.
3.3. Рассмотрение статистической информации по вопросам культуры и этноса на особо охраняемых природных территориях.
3.4. Рекомендации по организации жизнеобеспечения коренного населения, проживающего на территории Шорского национального парка.
3.5. Анализ практики применения природоохранного законодательства и подготовка предложений о внесении в него необходимых изменений.
3.6. Методическое содействие в подготовке и выпуске природоохранной литературы областного уровня по проблемам особо охраняемых природных территорий.