Управление в соответствии с возложенными на него задачами выполняет следующие функции:
разрабатывает с участием заинтересованных территориальных органов федеральных органов исполнительной власти проекты нормативных актов края в сфере использования и воспроизводства природных и земельных ресурсов (кроме недр), охраны окружающей среды, организации и функционирования особо охраняемых природных территорий;
обеспечивает совместно с природоохранными организациями края и органами местного самоуправления внедрение рыночных отношений и экономических механизмов в области использования, воспроизводства и охраны природных и земельных ресурсов (кроме недр);
организует разработку и реализацию краевых программ в области использования и воспроизводства природных и земельных ресурсов (кроме недр), охраны окружающей среды, организации и функционирования особо охраняемых природных территорий, координирует деятельность заинтересованных учреждений и организаций, связанную с реализацией этих программ;
разрабатывает и осуществляет меры по развитию особо охраняемых природных территорий, земель традиционного природопользования;
осуществляет совместно с федеральными органами исполнительной власти подготовку материалов на предоставление природных и земельных ресурсов (кроме недр) в пользование с подготовкой предложений по условиям и порядку их пользования;
организует учет природных и земельных ресурсов (кроме недр) и их кадастровую оценку;
готовит предложения о формах и размерах платы за пользование земельными и лесными ресурсами, объектами животного мира, водными объектами;
разрабатывает и вносит предложения в проекты краевых бюджетов;
организует проведение научно - исследовательских и опытно конструкторских работ в области использования и воспроизводства природных и земельных ресурсов (кроме недр), охраны окружающей среды;
организует и осуществляет совместно с территориальными органами федеральных органов исполнительной власти государственный контроль в области использования и воспроизводства природных и земельных ресурсов (кроме недр) и охраны окружающей среды;
координирует деятельность Красноярского краевого государственного экологического фонда и осуществляет контроль за целевым использованием средств этого фонда;
осуществляет координацию действий природоохранных организаций в области использования, воспроизводства природных и земельных ресурсов (кроме недр), охраны окружающей среды;
рассматривает заявления, предложения и обращения граждан и принимает по ним необходимые меры, участвует в приеме граждан по вопросам, относящимся к компетенции Управления;
организует экологическое воспитание и информирование местного населения;
осуществляет подготовку проектов договоров между органами государственной власти Красноярского края и органами государственной власти субъектов Российской Федерации в области природопользования и охраны окружающей среды.