Функциональную основу формируемой сети ООПТ составляют значительные по площади государственные природные заповедники, национальные и природные парки (как существующие, так и проектируемые) с наиболее жестким режимом охраны эталонных участков наземных и водных экосистем. Схема предусматривает поэтапное увеличение этих категорий ООПТ.
Для сохранения ландшафтов, защиты мест обитания (произрастания) группировок редких видов растений и животных, нуждающихся в особой охране и включенных в Красные книги Российской Федерации и Красноярского края, Схемой предусматриваются комплексные государственные природные заказники краевого значения.
Важным структурным элементом Схемы является государственный эколого - этнографический заказник федерального значения, образованный для сохранения традиционного образа жизни и социального развития коренных малочисленных народов Севера.
Сеть ООПТ включает как действующие, так и проектируемые государственные природные заказники краевого значения, выполняющие функции резерватов хозяйственно - ценных растений и животных для обеспечения охраны наиболее важных воспроизводственных участков, мест массового пролета и зимовок диких животных.
Памятники природы краевого значения, как уникальные естественные объекты, имеющие большое научное, познавательное, культурное значение и составляющие неотъемлемую часть ландшафтов, входят в состав Схемы в качестве дополнительных элементов.
В целях поддержания экологического баланса обеспечения функционального единства региональной сети ООПТ Схема дополняется зелеными зонами поселений, биологическими станциями и другими объектами, режимы природопользования в которых позволяют обеспечивать сохранение биологического и ландшафтного разнообразия.