Деятельность инспекции по обеспечению безопасности плавания судов, охраны жизни людей на воде, контроля за правильным пользованием поднадзорными судами и базами для их стоянок на водоемах Красноярского края финансируется из бюджета Красноярского края, а также за счет получаемых доходов и иных источников.
Доходы инспекции состоят из поступлений за проведение технического надзора и классификацию судов, технические освидетельствования и осмотры судов и баз (сооружений) для их стоянок, техническое освидетельствование объектов для массового отдыха, регистрацию и перерегистрацию судов, прием экзаменов на право управления маломерными судами, проверку знаний судоводителей, дачу заключения, рассмотрение и проверку проектно технической документации, экспертные и другие работы, связанные с осуществлением ею своих обязанностей.
Имущество инспекции включает состоящие на балансе основные и оборотные фонды, другие материальные ценности и средства, закрепленные за нею. Инспекция владеет, пользуется и распоряжается имуществом на правах оперативного управления по договору с краевым комитетом по управлению государственным имуществом.
Инспекция ведет законченный бухгалтерский учет, а также оперативный статистический учет своей деятельности.