5.1. Охрана заказника осуществляется уполномоченным органом исполнительной власти края.
5.2. Охрана территории заказника, переданной по договору в пользование научно-исследовательским, образовательным учреждениям и другим организациям, осуществляется этими организациями.
5.3. Государственный контроль в области организации и функционирования заказника осуществляется органом исполнительной власти края, осуществляющим государственный контроль и надзор в области организации и функционирования особо охраняемых природных территорий.
5.4. Управление заказником осуществляется специально созданным краевым государственным учреждением «Дирекция по особо охраняемым природным территориям Красноярского края».