Задачами Отдела являются:
обеспечение Губернатора края, Совета администрации края, Законодательного Собрания Красноярского края, органов исполнительной власти края бесперебойной, оперативной и достоверной шифрованной связью и обеспечение защиты сведений, составляющих государственную тайну, при выполнении ими своих полномочий;
своевременный доклад поступивших шифртелеграмм, секретных документов и сведений конфиденциального характера адресатам и по их резолюциям - исполнителям;
осуществление контроля за сроками исполнения шифртелеграмм, секретных документов и документов конфиденциального характера и поручений по ним, данными Губернатором края - Председателем Совета администрации края;
разработка и практическое осуществление мероприятий по организации шифрованной связи непосредственно в аппарате Совета администрации края, обеспечение функционирования и безопасности шифрованной связи;
обеспечение готовности работы Отдела в мирное время и в условиях военного времени;
предотвращение необоснованного допуска и доступа лиц к сведениям, составляющим государственную тайну, в аппарате Совета администрации края;
выявление и закрытие возможных каналов утечки сведений, составляющих государственную тайну, в процессе деятельности аппарата Совета администрации края;
организация работы по техническому оснащению программными средствами защиты и разграничению доступа к информации с использованием криптографических средств защиты в аппарате Совета администрации края;
обеспечение защиты государственной тайны при осуществлении Советом администрации края международных, научно-технических, торгово-экономических и иных связей;
организация и ведение секретного делопроизводства в аппарате Совета администрации края;
получение и отправка документов, содержащих сведения, составляющие государственную тайну, и информации конфиденциального характера, в том числе с пометками “Лично”, через Управление специальной связи по Красноярскому краю и Отдел государственной фельдъегерской службы Российской Федерации в г.Красноярске;
организация и проведение специальной подготовки специалистов по защите государственной тайны органов исполнительной власти края, органов местного самоуправления;
организация и координация разработки, внедрения и эксплуатации системы мер по безопасности информации, обрабатываемой техническими средствами, в целях предотвращения утечки информации по техническим каналам в аппарате Совета администрации края.