Контроль за реализацией мероприятий программы осуществляет комитет по вопросам семьи, материнства и детства администрации края путем ежеквартального заслушивания отчетов о ходе выполнения мероприятий программы.
В качестве метода оперативного контроля применяется ежемесячное рассмотрение выполнения программы.
Контроль за целевым расходованием бюджетных средств осуществляют главные распорядители бюджетных средств: Главное финансовое управление администрации края, управление социальной защиты населения администрации края, Главное управление образования администрации края, управление здравоохранения администрации края, управление культуры администрации края, комитет по молодежной политике и делам несовершеннолетних администрации края, комитет по физической культуре, спорту и туризму администрации края, управление начального профессионального образования администрации края, управление по делам казачества и кадетских учебных заведений администрации края.