Государственным заказчиком программы является администрация Красноярского края. Функции формирования и реализации политики поддержки и развития малого предпринимательства в Красноярском крае возложены на комитет по поддержке и развитию малого предпринимательства администрации края.
Государственный заказчик осуществляет текущий контроль за ходом реализации программы, использованием бюджетных средств, выделяемых на выполнение мероприятий, и ежеквартально докладывает результаты на заседаниях Совета администрации Красноярского края.